摘要：

本文针对生物信息学中的分子三维结构显示软件的建模问题进行了分析和研究，介绍了Java3D技术中关于场景图等概念以及基于Web的可视化系统的分析和设计方法。在此基 础上，我们详细讨论了分子的几何模型和运动模型，提出了一种基于Java3D的交互式分子三维结构显示软件的建模方法。最后，在相应软件系统HJMV的实现中，给出了几种提
 高该软件运行速度的方法。

关键词: 分子三维结构 生物信息学 Java3D 场景图 几何模型 运动模型