• 中国计算机学会会刊
  • 中国科技核心期刊
  • 中文核心期刊

J4 ›› 2005, Vol. 27 ›› Issue (7): 67-68.

• 论文 • 上一篇    下一篇

一种基于二叉树的快速穷举化搜索算法

文元桥[2] 周敬利[1] 余胜生[1]   

  • 出版日期:2005-07-01 发布日期:2010-07-03

  • Online:2005-07-01 Published:2010-07-03

摘要:

本文在构造具有方向导向性的完全二叉树的基础上,提出了一种适合研究蛋白质构象的格子模型快速穷举搜索算法,该算法通过使用序列分解、排列分类方法,将复杂度为2^ m种的CN^m次搜索变成复杂度为m种的CN^m次搜索,大大提高了利用格子模型搜索蛋白质能量最低构象的速度。同时,由于二叉树良好的方向性,有效地避免了搜索的盲目性。

关键词: 格子模型 二叉树 序列分解 构象搜索