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J4 ›› 2005, Vol. 27 ›› Issue (9): 74-76.

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基于有效性测度的基因表达数据的模糊聚类分析

刘青[1] 邓庆山[2]   

  • 出版日期:2005-09-01 发布日期:2010-07-03

  • Online:2005-09-01 Published:2010-07-03

摘要:

本文讨论了模糊聚类中的模糊C均值算法和聚类有效性测度。结合基因微阵列的特点,设计并实现了一种基于聚类有效性函数的模糊C均值模型。将该种模型运用于公开的白血病基因表达数据,取得了与实际情况相吻合的实验结果。

关键词: 基因表达数据 模糊聚类 FCM 聚类有效性 Xie-Beni指数

Abstract:

This paper discusses the fuzzy C-means algorithm(FCM) , one of the fuzzy clustering methods and clustering validity measurements. Considering the characteristics of microarray, we design and realize a FCM model based on clustering validity functions. We apply the model to the gene expression data ofleukaemia and gain a good result which is close to the fact.

Key words: (gene expression data, fuzzy clustering, FCM;clustering validity, Xie-Beni index)